As questões relacionadas ao bem estar animal (BEA) e a bioética tem sido alvo de grandes discussões, principalmente quando se referem aos Centros de Controle de Zoonoses (CCZ). O referido órgão é responsável pelo controle da população canina e, consequentemente, de zoonoses vigentes nas cidades. Nesse contexto, podem-se observar problemas decorrentes de uma série de fatores que, muitas vezes, afetam não apenas a saúde pública, mas também o bem estar animal e os conflitos dos profissionais com a população. Considerando, pois, tal realidade, objetivou-se analisar as atividades dos profissionais do CCZ do município de Mossoró/RN, e sua relação com a comunidade e o bem-estar animal. Para isso, foi realizada pesquisa de campo no CCZ local, com observação e acompanhamento das atividades desenvolvidas pela instituição, bem como aplicação de questionário com perguntas abertas e fechadas aos 36 funcionários do CCZ. A pesquisa se estendeu ainda para cinco bairros da cidade, onde foram aplicados questionários, também com perguntas abertas e fechadas, a 385 moradores dos respectivos bairros. Os dados obtidos após a aplicação dos questionários foram submetidos à análise estatística com auxílio do Programa R, utilizando-se os testes qui-quadrado, exato de Fisher, com um nível de significância de 5%. A partir da observação das atividades desenvolvidas pelo CCZ local constatou-se que este não atende a todos os objetivos específicos estabelecidos pela Fundação Nacional de Saúde (FUNASA), e que sua estrutura física não condiz com as diretrizes preconizadas também por esta, o que compromete o bem-estar dos animais alojados. Além disso, embora a maioria dos profissionais saiba o que é bem estar animal, apenas uma pequena parcela conhece assuntos relacionados à bioética. No tocante a percepção da comunidade, a maioria dos pesquisados não sabe o que são os centros de controle de zoonoses, sua finalidade e quais os programas existentes. Quanto a percepção dos profissionais do CCZ quanto a sua relação com a comunidade evidencia que, existem dados conflitantes, uma vez que os mesmos consideram que a sua relação é harmoniosa, porém relatam que existem preconceito e/ou resistência por parte da população para com seu trabalho, a maioria das pessoas afirma que não adotaria animal procedente da referida instituição, podendo-se evidenciar certo grau de insegurança e preconceito para com esta. Conclui-se que há uma necessidade perceptível quanto à ampliação dos serviços ofertados pelo CCZ à população, além da melhoria no que diz respeito às condições de trabalho na instituição, a fim de garantir o bem estar animal, e que isso só se tornará viável com esforços e interesse do poder público.